量子力学推导的可转移Lennard_Jones和Morse势数据集_用于半胱氨酸和烷硫醇在Au_111_表面吸附模拟

数据集概述

本数据集包含复现论文结果所需的DFT计算数据、MD拟合代码及相关文件，围绕半胱氨酸和烷硫醇在Au(111)表面吸附的可转移Lennard-Jones和Morse势模型构建展开，支持从DFT势能面计算到LAMMPS模拟的全流程复现。

文件详解

• 压缩文件:
• DFT.zip: 包含DFT计算相关文件，内部结构分为DFT_PES（势能面数据、脚本、VASP输入文件等）、各分子优化构型文件夹及Python/Bash脚本
• MD.zip: 包含MD拟合相关文件，内部结构分为Fitting（势能拟合脚本）、Histogram（LAMMPS模拟输入文件）、Single_point_scan（单点能扫描文件）及分子几何文件
• 文档与图片:
• README.md: 数据集说明文档，含结构、复现步骤及引用信息
• FigS1.jpeg: 补充图片文件

适用场景

• 材料科学研究: 研究半胱氨酸和烷硫醇在Au(111)表面的吸附行为
• 计算化学模拟: 复现DFT势能面计算及经典力场参数拟合流程
• 分子动力学应用: 基于LAMMPS开展表面吸附体系的MD模拟
• 力场开发: 参考可转移势模型构建方法，拓展至其他分子-表面体系