数据集概述
本数据集围绕单殖吸虫锚形态测量展开，包含13种Ligophorus属单殖吸虫的锚形状、大小数据及分子系统发育信息，涉及马来西亚两种鲻科鱼类宿主。数据支持系统学分类、系统发育信号检测及进化过程分析，配套有专用R分析工具包，共含7个文件。
文件详解
- MAFFT aligned trimmed.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：经MAFFT比对并修剪的序列数据压缩包
- monogeneaGM R script.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：单殖吸虫锚形态测量分析专用R包脚本压缩包
- MSA_18S_ITS1_28S.fas
- 文件格式：FAS
- 内容说明：18S rRNA、ITS1、28S rRNA基因序列比对文件
- Ligophorus image data.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：Ligophorus属单殖吸虫图像数据压缩包
- ligotps.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：Ligophorus属锚形态测量TPS格式数据压缩包
- MAFFT aligned untrimmed.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：经MAFFT比对未修剪的序列数据压缩包
- ligophorus_MLtree.nwk
- 文件格式：NWK
- 内容说明：Ligophorus属单殖吸虫最大似然法系统发育树文件
数据来源
论文“Monogenean anchor morphometry: systematic value, phylogenetic signal, and evolution”
适用场景
- 寄生蠕虫系统学研究：利用锚形态测量数据进行单殖吸虫物种鉴别与分类
- 进化生物学分析：检测锚形态特征的系统发育信号及进化约束机制
- 寄生虫-宿主协同进化研究：分析单殖吸虫锚形态与宿主鱼类的关联演化模式
- 生物形态测量方法学应用：验证几何形态测量技术在寄生蠕虫研究中的适用性
- 分子系统学与形态数据整合分析：结合基因序列与形态特征开展综合系统发育研究
- 生物信息工具开发参考：基于monogeneaGM R包构建寄生虫形态分析流程
