数据集概述
本数据集围绕Lissamphibia起源展开,采用化石作为终端分类群,结合分子与形态数据,通过贝叶斯方法估算分歧时间。包含系统发育分析所需的形态、分子数据文件及分析结果文件,共10个文件,用于探究Lissamphibia的单系性、演化位置及起源时间。
文件详解
- .tre格式文件(共5个)
- 文件名称:TMA_2Clock.tre、tmDNA.tre、tma.tre、morph.tre、TMA_1Clock.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:系统发育树文件,记录物种间的演化关系及分歧时间估算结果,包含节点分支、时间刻度等信息
- .nex格式文件(共3个)
- 文件名称:morph.nex、tma.nex、tmDNA.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:数据矩阵文件,存储形态特征数据(morph.nex)、分子与形态联合数据(tma.nex)、分子数据(tmDNA.nex),包含分类群列表、特征矩阵等
- .xml格式文件(共2个)
- 文件名称:TMA_1Clock.xml、TMA_2Clock.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:贝叶斯分析参数配置文件,记录分歧时间估算的模型设置、时钟模型参数等元数据
数据来源
论文“Data from: Divergence time estimation using fossils as terminal taxa and the origins of Lissamphibia”
适用场景
- Lissamphibia系统发育研究: 分析其单系性、演化位置及与Lepospondyli的亲缘关系
- 生物分歧时间估算: 探究Lissamphibia的起源时间及关键演化节点的时间尺度
- 化石与分子数据整合分析: 研究化石作为终端分类群在系统发育分析中的应用价值
- 演化生物学方法验证: 评估贝叶斯方法在整合形态与分子数据估算分歧时间中的准确性