数据集概述
本数据集基于139个转录组来源的核单核苷酸多态性(SNP)位点,分析喀尔巴阡蝾螈(Lissotriton montandoni)的遗传结构及与光滑蝾螈(L. vulgaris)的种间基因流。数据揭示喀尔巴阡蝾螈的两个分化种群可能源于东喀尔巴阡山脉的不同避难所,以及近期种间基因渗入现象,为种群遗传研究提供支持。
文件详解
- 文件名称:SNP_mon_vul.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含139个转录组来源的核单核苷酸多态性(SNP)位点数据,涉及喀尔巴阡蝾螈(Lm)和光滑蝾螈(Lv)的种群遗传信息,具体字段可能包括种群编号、个体ID、SNP位点基因型、分化指数、基因流水平等遗传分析相关指标。
数据来源
论文“Single nucleotide polymorphisms reveal genetic structuring of the Carpathian newt and provide evidence of interspecific gene flow in the nuclear genome”
适用场景
- 种群遗传结构分析: 研究喀尔巴阡蝾螈种群的遗传分化、避难所起源及扩散路径。
- 种间基因流研究: 分析喀尔巴阡蝾螈与光滑蝾螈的核基因组基因渗入水平及时空动态。
- 遗传标记开发应用: 验证转录组来源SNP标记在两栖动物种群遗传研究中的有效性。
- 基因组异质性分析: 探究种间分化中异常位点(outlier loci)与基因流异质性的关联。
- 生物地理学研究: 结合遗传数据推断喀尔巴阡蝾螈的历史分布变迁与地理隔离机制。