流感病毒基因序列与患者临床信息数据集InfluenzaVirusGeneSequenceandPatientClinicalInformationDataset-sajalmaheshwari
数据来源:互联网公开数据
标签:流感病毒, 基因测序, 临床数据, 流行病学, 病毒学, 序列分析, 数据挖掘, 疾病预测
数据概述:
该数据集包含来自Sajal Maheshwari的研究,整合了流感病毒的基因序列信息和患者的临床特征。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注具体时间范围,但包含“CollectionYear”(采集年份)字段,可以进行时间序列分析。
地理范围:数据包含了病毒采集的地理位置信息,如“Country”(国家)、“State_Province”(省/州)、“City_Local”(城市/地区),覆盖范围有待进一步考证。
数据维度:数据集包含多个维度的数据,涵盖了病毒基因序列、患者临床信息和流行病学特征。主要字段包括:
CollectorInstitution(采集机构)
HostIdentifier(宿主标识符)
SampleIdentifier(样本标识符)
CollectionYear(采集年份)
CollectionSeason(采集季节)
Country(国家)
State_Province(省/州)
City_Local(城市/地区)
SubjectAge(患者年龄)
Gender(性别)
Subtype(亚型)
Type(型别)
Strain(毒株)
SequenceAccession(序列登录号)
Temperature(温度)
SuddenOnset(突发)
M231N, M226F, M227A, M230T, M234E, Adamantanceresistance(抗药性相关基因突变)
NA275YN1, NA292KN2, NA119VN2, NA294SN2 (神经氨酸酶相关突变)
Oseltamivirresistance(奥司他韦耐药性)
PB1, F266S, PB2E627K, PB2D701N, Increasedvirulence (聚合酶相关突变)
PB2A199S, PB2A661T, PB2V667I, PB2K702R, PAS409N, NPL136M, M2A16G, M2C55F(聚合酶相关突变)
EnhancedtransmissiontoHuman(增强的人类传播)
NS1T92E, RERRRKKR(NS1蛋白相关)
SampleAccession(样本登录号)
ContactEmailAddress(联系邮箱地址)
OnsetHours(发病时间)
VaccinationStatus(疫苗接种状态)
Fever(发烧)
Symptoms(症状)
Pre-VisitMedications(就诊前用药)
MedicalConditions(既往病史)
Diagnosis(诊断)
PostVisitMedications(就诊后用药)
FluTestStatus(流感检测状态)
SampleType(样本类型)
DiseaseOutcome(疾病结局)
MiscellaneousComments(其他备注)
数据格式:CSV格式,文件名为data_age.csv,方便进行数据分析和处理。
来源信息:数据来源于Sajal Maheshwari的研究,具体来源信息有待补充。
该数据集适合用于研究流感病毒的基因进化、传播规律、耐药性分析,以及患者临床特征与病毒基因型的关联性研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于病毒学、流行病学、生物信息学等领域的学术研究,如病毒进化分析、基因组关联分析、耐药性预测、疾病风险评估等。
行业应用:可以为公共卫生部门、制药企业、医疗机构提供数据支持,特别是在流感疫情监测、疫苗研发、药物靶点筛选等方面。
决策支持:支持卫生健康部门的疾病防控决策,协助制定疫苗接种策略、药物使用指南等。
教育和培训:作为生物信息学、病毒学、医学等相关课程的案例分析素材,帮助学生深入理解病毒基因组学和临床医学知识。
此数据集特别适合用于探索流感病毒的基因变异与临床表现之间的关系,以及评估不同因素对疾病传播和预后的影响,从而为疾病的预防、诊断和治疗提供科学依据。