数据集概述
本数据集包含2000-2012年人类季节性流感病毒(A/H1N1、A/H3N2、B/Victoria、B/Yamagata)的9604条血凝素序列分析相关数据,记录病毒全球传播模式、抗原漂移差异及流行病学特征,支持病毒进化与传播机制研究。
文件详解
- 数据文件(.tsv、.txt)
- 文件名称:melb_isolations.tsv、strain_table.tsv、vic_large.tsv、yam_large.tsv、h3_large.tsv、vic_antigenic_data.txt
- 文件格式:TSV、TXT
- 字段映射介绍:包含病毒类型、毒株名称、感染年龄、采样日期、地理区域、国家、具体位置、基因序列登录号等信息;vic_antigenic_data.txt记录B型流感病毒抗原数据
- 进化树文件(.trees)
- 文件名称:vic_large_sample.trees、h1_large_sample.trees等8个.trees文件
- 文件格式:TREES
- 字段映射介绍:存储流感病毒毒株的系统发育进化树结构数据
- 地理信息文件(.xml)
- 文件名称:vic_large_geo.xml、h3_large_geo.xml、yam_large_geo.xml等8个.xml文件
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含流感病毒传播的地理元数据信息
数据来源
论文“Global circulation patterns of seasonal influenza viruses vary with antigenic drift”
适用场景
- 流感病毒传播动力学研究: 分析不同亚型流感病毒的全球时空传播模式差异
- 病毒抗原漂移机制分析: 结合血凝素序列数据研究抗原漂移速率与传播能力的关联
- 流行病学特征关联: 探索感染年龄、传播频率与病毒全球扩散模式的相互作用
- 公共卫生策略制定: 为流感监测网络优化及疫苗株选择提供数据支持