流感疫苗反应预测的转录组原始计数数据集

数据集概述

本数据集包含2017-2018年冈比亚儿童流感疫苗接种前(第0天)的鼻拭子和全血样本转录组数据(RNA-seq),用于支持免疫预测框架immunaut的开发,为疫苗反应预测提供基础转录组学数据支持。

文件详解

该数据集以压缩包形式提供,包含以下内容: - 文件名称: transcriptome_data.zip - 文件格式: ZIP压缩包 - 内部结构: 包含两个子目录及对应数据文件 - blood/目录: 全血样本转录组计数数据 - blood/dataset_2017.parquet: 2017队列数据,基因列(gene)+哈希化参与者ID列 - blood/dataset_2018.parquet: 2018队列数据,格式同上 - nasal/目录: 鼻拭子样本转录组数据 - nasal/dataset_2017.parquet: 2017队列标准化数据,基因行索引+哈希化参与者ID列 - nasal/dataset_2018.parquet: 2018队列计数数据,格式同上

数据来源

Zenodo

适用场景

  • 疫苗免疫学研究: 分析流感疫苗接种前转录组特征与免疫反应的关联
  • 预测模型开发: 作为immunaut框架等疫苗反应预测模型的输入数据
  • 转录组学分析: 开展基因集富集分析(GSEA)等通路水平研究
  • 儿童免疫研究: 探究冈比亚儿童群体流感疫苗免疫应答的基线决定因素
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 15.52 MiB
最后更新 2025年12月21日
创建于 2025年12月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。