数据集概述
本数据集围绕酵母单基因座不完全显性导致的适应度谷,利用酿酒酵母雪花系统实验体系,探究二倍体酵母从单细胞向多细胞转变过程中杂合性丢失(LOH)对适应进化的作用,包含表型与适应性表征、LOH事件观测等实验数据,共7个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:BBC_2022_README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(通讯作者Beatriz Baselga Cervera及机构、联系方式,合作研究者信息等)、数据集基本说明,生成时间为2022-05-25
- 原始数据类文件
- 文件名称:Raw_data__Settling_experiment_plates_CFUs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:沉降实验平板菌落形成单位(CFUs)原始数据
- 文件名称:Raw_data_fitness_by_CFUs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于CFUs的适应性原始数据
- 文件名称:Raw_data_Sizing.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:细胞大小测定原始数据
- 文件名称:Raw_data__Settling_experiment_FlowCam_data_adter_10_passes.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含ParticleID(颗粒ID)、AreaABD(面积)、AspectRatio(长宽比)、CircleFit(圆形拟合度)、DiameterABD(直径)、DiameterESD(等效球直径)、Elongation(伸长率)、Perimeter(周长)、Roughness(粗糙度)、VolumeESD(等效球体积)、Width(宽度)、source(来源)等字段的沉降实验FlowCam检测原始数据
- 文件名称:Raw_data_TECAN.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:TECAN实验原始数据
- 文件名称:Raw_data__counts_and_total_cells_under_the_microscope.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:显微镜下细胞计数及总细胞数原始数据
数据来源
明尼苏达大学实验进化研究团队
适用场景
- 酵母进化生物学研究: 分析二倍体酵母从单细胞向多细胞转变的进化机制
- 杂合性丢失(LOH)功能验证: 探究LOH在酵母适应度谷跨越中的作用及分子机制
- 微生物表型与适应性关联分析: 基于CFUs、细胞大小等数据研究酵母表型与适应性的关系
- 实验进化体系优化: 为酵母多细胞化实验进化体系的改进提供数据支撑