数据集概述
本数据集包含美国加州果园及葡萄园中的黑麦草(Lolium perenne ssp. multiflorum)种群遗传多样性与结构研究数据,涉及14个种群、412个个体的12个微卫星标记基因型信息,旨在揭示抗草甘膦杂草的基因流动机制,为农业杂草抗药性管理提供科学依据。
文件详解
- 说明文件(README)
- 文件名称:README_for_LoliumSSRgenalex.txt、README_for_LoliumSSRgenepop.txt、README_for_LoliumSSRstructure.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别对应三种基因数据分析格式的说明文档,解释数据来源、格式规则及缺失值编码(如STRUCTURE格式缺失值为-9,Genalex格式缺失值为0)
- 基因数据文件
- 文件名称:LoliumSSRgenepop
- 文件格式:无扩展名(GENEPOP格式)
- 字段映射介绍:适用于基因数据分析软件转换的基因型原始数据文件
- 结构分析文件
- 文件名称:LoliumSSRstructure.str
- 文件格式:STR
- 字段映射介绍:适配STRUCTURE软件的种群结构分析数据,采用1列格式编码
- Excel格式数据文件
- 文件名称:LoliumSSRgenalex.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:适配Genalex Excel插件的基因型数据,采用2列格式编码,包含12个微卫星标记的种群遗传信息
数据来源
论文“Genetic diversity and structure of Lolium perenne ssp. multiflorum in California vineyards and orchards indicates potential for spread of herbicide resistance via gene flow”
适用场景
- 农业杂草抗药性研究:分析黑麦草种群抗草甘膦基因的传播路径与机制
- 种群遗传学分析:利用微卫星标记数据研究黑麦草种群的遗传多样性与结构特征
- 农业生态管理:为果园及葡萄园杂草抗药性防控策略制定提供基因流动数据支持
- 分子生物学研究:通过SSR标记数据分析黑麦草种群的基因交流模式与遗传分化程度