数据集概述
本数据集围绕龙虱总科的系统基因组学研究，包含从直系同源基因分配到超级矩阵构建各阶段的序列数据，涉及氨基酸与核苷酸序列的原始、过滤及比对版本，为分析系统发育冲突和系统误差提供支持。
文件详解
该数据集包含4个压缩文件，具体说明如下：
- 原始直系同源基因文件：
- 文件名称：01.aaCOGS_and_nCOGs_unaligned_unfiltered.tar.gz
- 文件格式：.tar.gz（压缩包）
- 内容：直系同源基因分配步骤生成的3057个氨基酸COGs及对应核苷酸COGs，未比对、未过滤
- 过滤比对序列文件：
- 文件名称：02.aaCOGs_and_nCOGs_aligned_filtered_unmasked.tar.gz
- 文件格式：.tar.gz（压缩包）
- 内容：2991个已比对的氨基酸COGs及对应密码子碱基序列比对结果，未进行ALISCORE比对 masking处理
- 氨基酸超级矩阵文件：
- 文件名称：03.aminoacid_supermatrices.tar.gz
- 文件格式：.tar.gz（压缩包）
- 内容：所有推断的氨基酸超级矩阵及对应分区文件
- 核苷酸超级矩阵文件：
- 文件名称：04.nucleotide_supermatrices.tar.gz
- 文件格式：.tar.gz（压缩包）
- 内容：所有推断的核苷酸超级矩阵及对应分区文件
适用场景
- 系统基因组学研究：用于构建龙虱总科的系统发育树，分析物种演化关系
- 系统发育冲突分析：探究不同序列数据（氨基酸/核苷酸）对系统发育推断的影响
- 直系同源基因研究：分析龙虱总科直系同源基因的特征与进化模式
- 系统误差评估：验证序列比对、过滤等处理步骤对系统发育结果的系统误差影响
