数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)LSJ1品系的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验于2011年3月22日在英国剑桥MRC分子生物学实验室完成,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为,包含视频及特征分析文件,可用于线虫行为特征研究。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:300 LSJ1 on food R_2011_03_22__15_53310.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为记录的原始或标准化数据文件(wcon格式)
- 特征分析文件
- 文件名称:300 LSJ1 on food R_2011_03_22__15_53310_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,由tierpsy软件生成
- 实验数据文件
- 文件名称:300 LSJ1 on food R_2011_03_22__15_53310.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基本参数(如总时长899秒、帧率30.03帧/秒、像素对应微米数4.72886)及26835个分割骨架数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究: 分析LSJ1品系线虫的运动模式、觅食行为等特征与基因的关联
- 神经生物学实验: 研究线虫神经系统对行为的调控机制
- 环境因素影响分析: 探究食物(OP50)、培养基等环境条件对线虫行为的影响
- 行为分析算法验证: 用于测试和优化线虫行为特征提取算法(如tierpsy软件)的性能
- 模式生物标准化实验: 作为秀丽隐杆线虫行为实验的参考数据集,支持跨实验室结果对比