数据集概述
本数据集包含两种近缘鳉鱼（Lucania goodei和L. parva）的遗传连锁图谱与同线性分析数据，涉及染色体核型分析、高密度SNP连锁图谱构建及物种间染色体融合事件验证，为研究物种分化伴随的基因组变化、生殖隔离遗传机制及盐度耐受性提供基础数据。
文件详解
- 文件名称：README_for_454large300Contigs.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含454large300Contigs序列的相关背景信息与使用说明
- 文件名称：454large300Contigs.fna
- 文件格式：FNA
- 字段映射介绍：核酸序列文件，存储454测序获得的300个Contigs的核苷酸序列数据
- 文件名称：L.parva-all-families-joinmapfile.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：L.parva全家族JoinMap格式数据文件，包含用于构建该物种遗传连锁图谱的标记与分型数据
- 文件名称：L.goodei-all-famillies-joinmapfile.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：L.goodei全家族JoinMap格式数据文件，包含用于构建该物种遗传连锁图谱的标记与分型数据
数据来源
论文“Insight into genomic changes accompanying divergence: genetic linkage maps and synteny of Lucania goodei and L. parva reveal a Robertsonian fusion”
适用场景
- 进化遗传学研究：分析Lucania属鱼类物种分化过程中的基因组结构变化，验证染色体融合事件
- 遗传连锁图谱应用：利用JoinMap格式数据构建高密度遗传连锁图谱，定位与盐度耐受性相关的基因位点
- 比较基因组学分析：通过同线性分析研究Lucania与远缘硬骨鱼（如青鳉）的染色体保守性
- 生殖隔离机制研究：为解析Lucania属鱼类生殖隔离的遗传基础提供基因组结构数据支持
- 生物信息学分析：基于核酸序列文件开展基因注释、SNP标记开发等下游分析
