数据集概述
本数据集为挪威伦德猎犬的分子遗传学研究数据，包含17只个体的全基因组SNP分型数据及相关遗传信息。因该品种近交和犬瘟热导致遗传多样性严重丧失，基于X染色体位点的标准性别鉴定方法存在误差，数据集通过Y染色体标记amelogenin验证了性别准确性，可用于分析犬类性别鉴定、品种血统及多指症的遗传机制。
文件详解
- README文件
- 文件名称：README_for_Lundehund1_information.txt、README_for_Lundehund1.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据对应的期刊论文信息、SNP原始数据的用途（适配PLINK软件）及包含的文件内容概述。
- 信息文件
- 文件名称：Lundehund1_information.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含个体的FID（家系ID）、IID（个体ID）、Sex（性别）信息，记录17只个体的性别标注。
- PLINK数据文件
- 文件名称：Lundehund1.map
- 文件格式：MAP
- 字段映射介绍：SNP位点列表文件，用于PLINK软件分析的位点参考数据。
- 文件名称：Lundehund1.ped
- 文件格式：PED
- 字段映射介绍：个体SNP分型数据文件，包含17个个体的165,293个SNP位点基因型信息。
- 遗传数据文件
- 文件名称：Kropatsch et al 2015 Norwegian Lundehund Y mtDNA genetic data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含挪威伦德猎犬Y染色体和线粒体DNA的遗传数据，用于验证性别鉴定准确性及血统分析。
数据来源
Journal of Heredity期刊论文：Kropatsch et al. Molecular genetics of sex identification, breed ancestry and polydactyly in the Norwegian Lundehund breed
适用场景
- 犬类性别鉴定方法优化：分析高度近交品种中X染色体位点性别鉴定的误差机制，优化基于Y染色体标记的鉴定方案。
- 犬类遗传多样性研究：利用SNP数据评估挪威伦德猎犬的遗传均一性，分析近交和疾病对品种遗传结构的影响。
- 犬类品种血统溯源：通过全基因组SNP分型数据解析挪威伦德猎犬的品种血统来源及遗传特征。
- 犬类多指症遗传机制分析：结合分子遗传数据探究挪威伦德猎犬多指症的相关基因位点及遗传模式。
- 犬类分子遗传实验方法验证：验证PLINK软件在犬类SNP数据处理中的适用性，为同类研究提供方法参考。
