数据集概述
本数据集为北美Fundulus notatus物种复合体（包括F. notatus、F. olivaceus、F. euryzonus三种食蚊鱼）的种群遗传研究数据，基于GBS技术获取的全基因组SNP，分析晚更新世分布扩张过程中的基因交流与渐渗模式，覆盖美国中南部墨西哥湾沿岸及密西西比河流域等区域的749个个体样本，包含18个分析相关文件。
文件详解
- 分析说明文档（共9个）
- 文件名称：README_for_structure_file_olivaceus.docx、README_for_SNAPP.docx等
- 文件格式：DOCX
- 内容：对应STRUCTURE、SNAPP、TreeMix、DIYABC等种群遗传分析方法的说明文档
- 分析输入文件（共8个）
- 文件名称：structure_file_notatus_.txt、DIYABColi.txt、treemix2sp.txt等
- 文件格式：TXT
- 内容：种群遗传分析工具的输入数据文件，包含SNP位点信息
- 系统发育分析文件（共1个）
- 文件名称：SNAPP.nex
- 文件格式：NEX
- 内容：用于SNAPP方法的系统发育分析输入文件
数据来源
论文“Late Pleistocene range expansion of North American topminnows accompanied by admixture and introgression”
适用场景
- 种群遗传学研究：用于分析Fundulus notatus物种复合体的种群遗传结构与分化模式
- 生物地理历史重建：探究晚更新世-全新世水系变化对食蚊鱼分布扩张的影响
- 基因渐渗分析：评估物种同域分布区的杂交与基因交流程度
- 进化模型验证：通过STRUCTURE、TreeMix等工具验证种群历史动态模型
- 保护遗传学研究：为北美淡水鱼类的遗传多样性保护提供数据支持
