数据集概述
本数据集包含基于转录组测序的多基因系统发育研究数据，旨在阐明箭虫（毛颚动物）的分类地位，核心结论为箭虫与轮虫同属颚口动物类群，并提出螺旋动物内新的"蠕虫类"分支（环节动物、扁形动物和纽形动物）。数据涵盖系统发育重建的比对文件与原始输出文件。
文件详解
- 原始基因家族比对文件：alis.tgz（TGZ格式），包含每个基因家族的原始比对数据
- 过滤后基因家族比对文件：alis_filtered.tgz（TGZ格式），经HMMClean和BMGE过滤、用于序列拼接的比对数据
- Dayhoff6重编码数据集贝叶斯分析文件：cat-gtr-dh6.tgz（TGZ格式），包含树文件和参数追踪文件
- 非重编码简化数据集贝叶斯分析文件：cat-gtr.tgz（TGZ格式），包含贝叶斯分析样本数据
- 系统发育分析用拼接比对文件：Concat-alis.tgz（TGZ格式），用于系统发育分析的拼接比对数据
- IQTree C20模型分析文件：IQTree-C20.tgz（TGZ格式），简化数据集使用C20模型的IQTree分析运行文件
- IQTree LG4X模型分析文件：IQTree-LG4X.tgz（TGZ格式），全矩阵使用LG4X模型的IQTree分析运行文件
- 系统发育分析结果文件：Results_phylogenetic_analyses.pdf（PDF格式），包含本研究生成的所有共识树
适用场景
- 动物系统发育研究：分析螺旋动物类群的演化关系
- 毛颚动物分类学研究：验证箭虫在颚口动物中的分类地位
- 分子系统学方法应用：探索多基因转录组数据在系统发育重建中的应用
- 演化生物学教学：作为系统发育分析流程的案例数据
- 生物信息学算法测试：用于评估不同模型（如LG4X、C20）在系统发育分析中的表现
