数据集概述
本数据集基于170K SNP芯片对15个中国本土犬种的169只无亲缘关系个体进行基因组分析,对比中国与西方犬种的基因组结构,包含群体结构、连锁不平衡模式、选择信号等核心内容,揭示中国本土犬种的遗传多样性特征及适应性进化机制,为复杂性状相关基因研究提供资源。
文件详解
- 文件名称:CW_ind_maf005_geno01_mind005.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:包含基于170K SNP芯片的中国本土犬种基因分型数据,涉及群体结构分析(PCA、NJ树)、连锁不平衡(LD)、纯合子运行(ROH)、遗传距离、选择信号(d统计量、选择性清除)等相关基因组数据,可用于解析中国与西方犬种的系统发育关系及适应性进化候选基因。
数据来源
LUPA(欧洲犬类基因组计划数据库)
适用场景
- 犬类群体遗传学研究:分析中国本土犬种的群体结构、遗传多样性及与西方犬种的系统发育关系。
- 适应性进化机制研究:基于选择信号识别高海拔适应(如EPAS1基因)、狩猎能力(如RBP7基因)、奔跑速度(如NOL8基因)等性状相关的候选基因。
- 犬类遗传资源保护:评估中国本土犬种的遗传多样性水平,为犬种资源保护策略制定提供数据支持。
- 复杂性状基因定位:利用选择信号分析结果,挖掘犬类体型、行为等复杂表型的遗传基础。