数据集概述
该数据集整合了绿背山鳟(Oncorhynchus clarkii)的历史种群记录与19世纪DNA样本的系统发育分析数据,用于揭示人类活动对其原生多样性及分布的影响,为濒危物种保护计划的制定提供历史基线支持。
文件详解
该数据集包含14个文件,具体说明如下:
- 说明文档(.txt格式,共7个):
- README_for_Weird_Bear_Creek_Kennedy_2010.txt:熊溪区域数据说明
- README_for_ND2_haplotype_table_April11_2012.txt:ND2单倍型表说明
- README_for_ND2COI_unique_430bp_HapNet.txt:ND2-COI基因单倍型网络说明
- README_for_Museum_sample_Table.txt:博物馆样本表说明
- README_for_Fasta_historic.txt:历史样本Fasta文件说明
- README_for_AMOVA_subsample_scripts.txt:AMOVA分析脚本说明
- README_for_All_subspecies_tree_430bp.txt:亚种系统发育树说明
- 数据文件:
- ND2_haplotype_table_April11_2012.xls:ND2基因单倍型数据表(Excel格式)
- Museum_sample_Table.xlsx:博物馆样本信息表(Excel格式)
- ND2COI_unique_430bp_HapNet.nex:ND2-COI基因单倍型网络数据(NEXUS格式)
- 压缩文件(.zip格式,共3个):
- All_subspecies_tree_430bp.zip:亚种系统发育树数据
- Fasta_historic.zip:历史样本基因序列Fasta文件
- AMOVA_subsample_scripts.zip:AMOVA分析脚本
- 文档文件:
- Weird_Bear_Creek_Kennedy_2010.pdf:熊溪区域研究文档
适用场景
- 濒危鱼类保护研究:分析人类活动对绿背山鳟原生多样性及分布的影响
- 分子生态学研究:通过历史DNA样本探究物种系统发育与种群演化
- 渔业管理应用:为鱼类种群恢复计划提供历史基线数据支持
- 生物多样性保护:评估人类介导的物种分布变化对生态系统的影响