数据集概述
本数据集为铜绿假单胞菌PAO1全基因组CRISPR干扰筛选的源数据，包含MAGeCK分析输出的计数、统计及基因富集文件，涉及不同培养条件和时间点的筛选结果，共54个文件，支持原核生物基因功能研究。
文件详解
- .tabular格式文件（49个）
- 文件名称示例：24h_Median_comp6.tabular、48h_Median_comp9.tabular、Median_48hLB vs 48hSucc_sgRNA Summary_comp11.tabular
- 内容说明：包含不同培养条件（LB、Glc、Succ等）和时间点（24h、48h）的sgRNA筛选结果、中位数比较及基因摘要数据
- .xlsx格式文件（5个）
- 文件名称：Readme_sgRNA_Summary and Gene_Summary files.xlsx、Table S2 - sgRNA statistics_all.xlsx、Table S1 - sgRNA counts_all.xlsx、Table S3 - Gene enrichment and depletion analysis_all significant_clustermap.xlsx等
- 内容说明：涵盖sgRNA计数、统计信息、基因富集与消耗分析及结果汇总表
适用场景
- 原核生物基因功能研究: 分析铜绿假单胞菌PAO1中基因的必需性及条件依赖性功能
- CRISPR筛选数据分析: 验证MAGeCK工具在原核生物全基因组筛选中的输出结果
- 基因富集分析: 利用基因富集文件探究特定培养条件下的差异表达基因及功能通路
- 微生物代谢研究: 比较不同碳源（LB、葡萄糖、琥珀酸）对细菌基因筛选结果的影响
- 生物信息学方法验证: 作为基准数据测试基因筛选数据分析算法的准确性
