数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了LX950品系ocr-4(vs137)IV基因突变体成虫的行为实验数据。实验于2010年4月22日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为特征,通过视频追踪获取运动参数,支持基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:
ocr-4 (vs137) on food R_2010_04_22__15_22_16__13.hdf5、ocr-4 (vs137) on food R_2010_04_22__15_22_16__13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频追踪生成的线虫行为特征数据,如骨架分割信息(共19345个分段骨架)、运动参数等;
_features.hdf5为提取的行为特征数据集
- 压缩数据文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:
ocr-4 (vs137) on food R_2010_04_22__15_22_16__13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,格式遵循wcon标准(线虫行为数据交换格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析ocr-4基因对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为学实验方法验证:基于E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为追踪技术的重复性与可靠性
- 基因突变体行为特征分析:对比野生型与突变体线虫的运动模式、速度等行为参数差异
- 神经生物学机制研究:关联基因表达与行为表型,探索线虫感知与运动调控的神经机制