数据集概述
本数据集为Lymexyloidea与Mordelloidea(鞘翅目:多食亚目:扁甲总科)系统基因组学研究的支撑数据,包含甲虫转录组与基因组的蛋白质序列比对文件、序列裁剪结果及系统发育树分析结果,用于相关研究论文的结果计算。
文件详解
该数据集包含12个文件,分布在2个目录中,具体说明如下:
- 主目录文件:
- 49beetles_alignments_2022.zip:压缩文件,含基础基因比对数据
- 49beetles_Gblock_alignments_2022.zip:压缩文件,含经Gblock程序裁剪的基因比对数据
- 49beetle_Gblock_final.fasta:FASTA格式,裁剪版序列的拼接比对结果
- File_S2_Morphological_matrix_Mordelloidea.dat:DAT格式,Mordelloidea形态学矩阵数据
- Results_tree analyses目录文件:
- ML_iqtree21_1a.treefile:treefile格式,IQtree程序最大似然分析的树结果
- GhostLG_iqtree24a_cut.tre:tre格式,IQtree程序GHOST分析的树结果
- Bayes_bpcomp5_6_7_8_9.tre:tre格式,PhyloBayes程序贝叶斯分析的树结果
- Bayes_Tracer log results.txt:TXT格式,贝叶斯分析的Tracer日志统计结果
- ML_iqtree21_1a.treefile.pdf、GhostLG_iqtree24a_cut.pdf、Bayes_bpcomp5_6_7_8_9.pdf、Bayes_Tracer log results.pdf:PDF格式,各类分析结果的可视化文档
适用场景
- 昆虫系统发育研究:用于分析Lymexyloidea与Mordelloidea类群的演化关系
- 基因组学数据分析:支持蛋白质序列比对、系统发育树构建等生物信息学分析
- 分类学研究:为甲虫类群的分类修订提供基因组学数据支撑
- 进化生物学教学:可作为系统基因组学研究方法的案例数据