数据集概述
本数据集为N6-甲基腺苷(m6A)调控CD4+T淋巴细胞CD40L表达研究的配套数据,包含meRIP测序的读段计数及基因表达量数据,涉及健康对照外周血来源CD4+T淋巴细胞样本。数据共5个文件,覆盖原始读段计数与标准化表达量及差异倍数,用于支持研究中m6A对CD40L表达调控机制的分析。
文件详解
- 读段计数文件(TXT格式,共4个)
- 文件名称:CD4ripctr3_sort_monoMapped_HTSeqOutput.txt、CD4inctr3_sort_monoMapped_HTSeqOutput.txt、CD4inbd3_sort_monoMapped_HTSeqOutput.txt、CD4ripbd3_sort_monoMapped_HTSeqOutput.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:每行包含基因ID(如ENSG00000000003)及对应读段计数(如0、418),记录健康对照CD4+T淋巴细胞meRIP测序的基因读段数
- 表达量与差异倍数文件(XLSX格式,1个)
- 文件名称:allLog2CPMexpressionValues_Log2FoldChange_TcellSamples.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含健康对照CD4+T淋巴细胞基因的TMM标准化log2(CPM+0.168)表达量,及每个基因的Log2FoldChange值
数据来源
论文“N6-Methyladenosine Directly Regulates CD40L Expression In CD4+ T Lymphocytes”
适用场景
- m6A RNA修饰调控机制研究:分析m6A对CD4+T淋巴细胞CD40L表达的直接调控作用
- 免疫细胞基因表达分析:利用标准化表达量数据研究健康CD4+T淋巴细胞的基因表达特征
- 免疫相关疾病机制探索:为免疫相关疾病中T细胞活化调控机制的研究提供数据支持
- 生物信息学数据分析:用于meRIP测序数据的读段计数、表达量标准化及差异分析方法验证