数据集概述
本数据集围绕马达加斯加特有宝石蛇亚科(Pseudoxyrhophiinae)的起源与多样性展开,包含基因组捕获数据、系统发育分析文件、物种分布坐标及形态特征数据,用于探究该类群的分化速率、生物群系适应及牙齿特征关联等演化问题。
文件详解
- 基因组数据文件:
- 1_AHA_Genomic_datazip.zip:ZIP格式,包含366个样本的基因组序列捕获原始或处理数据
- 分析代码与流程文件:
- 3_Code.zip:ZIP格式,可能包含用于数据分析的代码脚本
- Additional_Text_Methods.docx:DOCX格式,补充方法说明文档
- 系统发育分析文件:
- 2_Phylogenies_comparative_data.zip:ZIP格式,比较系统发育分析相关数据
- Fig_S1_Sanger_Tree_AHA_tree_incongruencies_red.pdf:PDF格式,Sanger测序构建的系统发育树及不一致性标注
- Fig_S2_Astral_Tree_732_Tips.pdf:PDF格式,包含732个分类单元的Astral树可视化结果
- 物种界定与时间校准文件:
- 5_BPP_by_Genus_Dates.zip:ZIP格式,基于属级的BPP物种界定及时间校准数据
- 空间分布数据文件:
- 4_Shapefiles_Species_Coordinates_EcoRegions.zip:ZIP格式,包含物种分布坐标及生态区shapefile文件
- 样本信息文件:
- 6_Sample_Data_Names_Sanger_AHA.xlsx:XLSX格式,Sanger测序及AHA分析的样本名称对照表
适用场景
- 演化生物学研究:分析马达加斯加宝石蛇亚科的物种分化速率及演化历史
- 生物地理学研究:探究岛屿生物区系形成机制及生态适应过程
- 基因组学分析:利用序列捕获数据进行系统发育重建与物种界定
- 保护生物学研究:基于物种分布数据评估马达加斯加特有蛇类的保护现状
- 形态演化研究:分析牙齿特征与生态适应及物种分化的关联