数据集概述
该数据集包含马达加斯加淡水及海洋鱼类的DNA条形码库相关资料,涵盖补充文档、系统发育树及整理后的DNA条形码数据,涉及COI、16S等基因序列,为研究马达加斯加受威胁鱼类的分类与系统发育提供数据支持。
文件详解
- 系统发育树文件(.tre格式):
- COI_all_aligned_rerooted_renamed.tre:COI基因序列的系统发育树文件
- 16Sall.tre:16S基因序列的系统发育树文件
- 序列文件(.fas格式):
- COI_all_aligned.fas:COI基因序列的比对文件
- 16Sall.fas:16S基因序列的比对文件
- 文档文件(.pdf格式):
- Madagascar_Fish_Barcoding_FigS1_COI_tree_24Jan2022.pdf:COI基因系统发育树图表文档
- Madagascar_Fish_Barcoding_FigS2_16S_tree_24Jan2022.pdf:16S基因系统发育树图表文档
- 条形码库数据文件:
- DNA_barcode_library_Madagascar_fishes_Tabdelimited_13June2022.txt:制表符分隔格式的DNA条形码库数据,包含Sortno、Voucher、Freshwater/Marine、Species、Family、Locality、基因序列登录号等字段
- DNA_barcode_library_Madagascar_fishes_Excel_13June2022.xlsx:Excel格式的DNA条形码库数据
适用场景
- 鱼类分类学研究:用于马达加斯加淡水及海洋鱼类的物种鉴定与分类
- 系统发育分析:基于COI和16S基因序列研究鱼类的演化关系
- 生物多样性保护:为马达加斯加受威胁鱼类的保护策略制定提供分子数据支持
- 分子生态学研究:分析鱼类种群结构与地理分布的关联