数据集概述
本数据集基于玉米授粉后14天胚乳和胚胎组织的RNA深度测序，从B73与Mo17基因型间存在序列多态性的约12,000个表达基因中，鉴定出100个推定印记基因（含54个母系表达基因、46个父系表达基因），并分析其DNA甲基化特征，含97个新印记基因及与水稻、拟南芥的印记保守性对比。
文件详解
- 文件名称：README_for_maize imprinting ms supplemental dataset1.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：补充数据集1的说明文档，关联研究论文《Waters et al. (2011) Plant Cell》
- 文件名称：README_for_tpc092668_SupplementalDS2.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：补充数据集2的说明文档，含数据收集与联系方式等信息
- 文件名称：tpc092668_SupplementalDS2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：研究相关的补充数据表格
- 文件名称：maize imprinting ms supplemental dataset1.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含约12,000个基因的RPKM表达值，字段含基因ID（来自maizesequence.org的AGP5b.50）等信息
数据来源
论文“Parent-of-origin effects on gene expression and DNA methylation in the maize endosperm”
适用场景
- 植物基因印记机制研究: 分析玉米胚乳中母系/父系表达基因的印记模式及DNA甲基化调控作用
- 作物分子遗传学分析: 探究玉米B73与Mo17基因型间基因表达的亲源效应差异
- 表观遗传学研究: 验证DNA甲基化水平与基因印记表达的关联机制
- 物种间基因印记保守性分析: 对比玉米与水稻、拟南芥的印记基因保守性特征
- 植物发育生物学研究: 解析玉米授粉后14天胚乳与胚胎组织的基因表达调控规律
