数据集概述
本数据集为2011年德国北部大肠杆菌O104:H4疫情相关的MALDI-TOF质谱分型研究数据,包含2个文件。核心内容是疫情菌株的特征质谱峰数据,以及非疫情相关菌株的对比谱图,用于验证MALDI-TOF质谱快速分型方法的有效性,为微生物实验室疫情菌株鉴定提供参考。
文件详解
- README_for_specs.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录数据集的背景信息,说明数据包含直接样品沉积谱图(dsd)、甲酸提取谱图(fae)、190株非疫情相关大肠杆菌的三重谱图(norec)及104株疫情相关大肠杆菌的三重谱图(orec)。
- specs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含研究中涉及的所有MALDI-TOF质谱谱图数据,具体内容需解压后查看。
数据来源
论文“Rapid MALDI-TOF mass spectrometry strain typing during a large outbreak of Shiga-Toxigenic Escherichia coli”(PLOS ONE, 2014)
适用场景
- 微生物疫情菌株快速鉴定: 利用特征质谱峰数据,实现大肠杆菌O104:H4疫情菌株的快速分型与识别。
- 质谱分型方法优化: 基于对比谱图分析,优化MALDI-TOF质谱在微生物菌株分型中的应用策略。
- 公共卫生应急响应: 为突发细菌性疫情的实验室快速检测提供技术参考和数据支持。
- 微生物蛋白质组学研究: 通过特征峰对应的蛋白质分析,探究大肠杆菌菌株的蛋白质组差异。