数据集概述
本数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的一个工作流,包含日本基因型表型档案(JGA)全基因组测序(WGS)数据处理相关的配置文件、工作流描述文件及说明文档,支持用户对JGA数据进行标准化分析。
文件详解
- 文件名称: README.md,文件格式: Markdown(.md),内容为JGA数据分析工作流的说明文档,介绍JGA中WGS数据的处理背景与流程。
- 文件名称: yevis-metadata-1.0.0.yml,文件格式: YAML(.yml),为工作流的元数据配置文件。
- 文件名称: qc-filter.cwl,文件格式: CWL(.cwl),质量控制过滤步骤的工作流描述文件。
- 文件名称: qc-report.cwl,文件格式: CWL(.cwl),质量控制报告生成步骤的工作流描述文件。
- 文件名称: wf_engine_params.json,文件格式: JSON(.json),工作流引擎参数配置文件,无具体键值对内容。
- 文件名称: wf_params.json,文件格式: JSON(.json),工作流参数配置文件。
数据来源
manabuishii/yevis-getting-started
适用场景
- 基因组学研究: 用于JGA平台全基因组测序数据的标准化处理与分析。
- 生物信息学工作流开发: 参考JGA数据处理流程的配置与实现方式。
- 数据共享与复用: 为JGA数据用户提供现成的分析工作流模板,提升数据使用效率。
- 质量控制流程优化: 基于现有QC过滤与报告生成配置,优化基因组数据质量控制环节。