数据集概述
本数据集为草地褐蝶(Maniola jurtina)的基因组从头组装成果,包含全基因组注释文件、蛋白质序列、斑点图案基因BLAST比对结果及功能注释数据,共5个文件,覆盖基因组结构与功能分析的核心内容,适用于昆虫基因组学与进化生物学研究。
文件详解
- 全基因组GFF文件
- 文件名称:Maniola.jurtina.gff3(原始)、Maniola_jurtina_filtered.gff3(过滤后)
- 文件格式:GFF3
- 字段映射介绍:包含基因组结构注释信息,过滤后文件保留了最小基因长度的有效注释
- 蛋白质序列文件
- 文件名称:Mjurtina_proteins.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:草地褐蝶的蛋白质序列集合
- 斑点图案基因BLAST比对结果
- 文件名称:Lepidoptera_MJ_protein_matches.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:鳞翅目斑点图案基因与草地褐蝶蛋白质组的BLAST比对匹配结果
- 功能注释文件
- 文件名称:blast2go_export.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含序列名称、描述、长度、BLAST比对结果、基因名称、GO术语及ID等功能注释信息
适用场景
- 昆虫基因组结构分析: 利用GFF文件研究草地褐蝶基因组的基因结构与分布特征
- 蛋白质组学研究: 通过蛋白质序列文件开展草地褐蝶蛋白质功能与进化分析
- 蝴蝶斑点图案基因研究: 基于BLAST比对结果探究斑点图案相关基因在草地褐蝶中的同源性
- 基因组功能注释分析: 利用blast2go注释数据解析草地褐蝶基因的生物学功能与通路