数据集概述
本数据集包含Marasmius oreades(仙环蘑菇)基因组组装v2的遗传连锁图谱和重复序列库,支持该物种基因组的重新组装、基因与重复序列预测,为突变积累研究提供自然模型系统的基础数据,共包含3个文件。
文件详解
- Maror2.repeat.library.2.2.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含Marasmius oreades基因组的重复序列库,记录手动编译和整理的重复序列信息。
- Maror2.linkage.map.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含遗传连锁图谱数据,预览内容显示包含染色体编号(如Chr1)、位置信息(如32889)、数值信息(如4.326)等字段。
- Maror2.repeat.families.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含重复序列家族的相关数据,记录重复序列的分类和特征信息。
适用场景
- 基因组组装优化: 利用遗传连锁图谱对Marasmius oreades基因组序列进行重新组装和校正。
- 重复序列分析: 通过重复序列库研究该物种基因组中重复序列的分布和特征。
- 突变积累研究: 作为自然模型系统,支持突变积累的相关研究和分析。
- 遗传图谱构建: 基于连锁图谱数据开展遗传标记定位和遗传结构分析。