Marasmius_Based_Marasmius_oreades基因组组装v2_连锁图谱与重复序列库数据

数据集概述

本数据集包含Marasmius oreades(仙环蘑菇)基因组组装v2的遗传连锁图谱和重复序列库,支持该物种基因组的重新组装、基因与重复序列预测,为突变积累研究提供自然模型系统的基础数据,共包含3个文件。

文件详解

  • Maror2.repeat.library.2.2.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:包含Marasmius oreades基因组的重复序列库,记录手动编译和整理的重复序列信息。
  • Maror2.linkage.map.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含遗传连锁图谱数据,预览内容显示包含染色体编号(如Chr1)、位置信息(如32889)、数值信息(如4.326)等字段。
  • Maror2.repeat.families.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含重复序列家族的相关数据,记录重复序列的分类和特征信息。

适用场景

  • 基因组组装优化: 利用遗传连锁图谱对Marasmius oreades基因组序列进行重新组装和校正。
  • 重复序列分析: 通过重复序列库研究该物种基因组中重复序列的分布和特征。
  • 突变积累研究: 作为自然模型系统,支持突变积累的相关研究和分析。
  • 遗传图谱构建: 基于连锁图谱数据开展遗传标记定位和遗传结构分析。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.49 MiB
最后更新 2025年12月31日
创建于 2025年12月31日
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