数据集概述
本数据集为普通狨猴肠道微生物组功能活性分析的补充表格集合,包含基因簇分配、协变分析参数、微生物分类、测序统计等11个表格,覆盖基因功能、样本信息、测序质量、物种组成等核心内容,支持肠道微生物组功能活性的深入研究。
文件详解
- 补充表格集合(Supplementary Tables)
- 文件名称:Supplementary_Table7.xlsx至Supplementary_Table17.xlsx(共11个文件)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:
- Table S7:未知基因簇的基因分配信息
- Table S8:协变分析参数确定用AUC值(基准测试数据)
- Table S9:关联的未知基因簇信息
- Table S10:普通狨猴个体基本信息
- Table S11:双索引序列信息
- Table S12:测序统计数据(如读长、覆盖度等)
- Table S13:总RNA样本的RIN评分(RNA完整性评分)
- Table S14:分类分析中前20种细菌物种信息
- Table S15:组装步骤中不同参数下非嵌合基因组覆盖的基因数量
- Table S16:合并步骤中不同参数下非嵌合基因组覆盖的基因数量
- Table S17:肠道位点间的距离信息
数据来源
论文“Intra-intestinal analysis of the functional activity of microbiomes and its application to the common marmoset intestine”
适用场景
- 肠道微生物组功能研究: 利用基因簇分配、物种组成数据,分析普通狨猴肠道微生物的功能活性与代谢通路
- 微生物组测序数据分析: 基于测序统计、RIN评分等数据,评估肠道微生物组测序数据的质量与可靠性
- 协变分析方法优化: 通过AUC值基准测试数据,优化微生物组数据协变分析的参数设置
- 非人灵长类肠道微生物模型构建: 结合狨猴个体信息与肠道位点距离数据,构建肠道微生物空间分布模型
- 微生物基因组组装参数评估: 利用组装/合并步骤的基因覆盖数据,筛选最优的微生物基因组组装参数