数据集概述
本数据集为四倍体马铃薯群体传递能力研究的配套数据，包含5013个F1群体克隆的系谱、10个表型（干物质含量等）及93170个SNP基因型数据，还提供系谱（A）、基因组（G）、单步合并（H）矩阵，共18个文件，支持马铃薯遗传育种分析。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含所有数据文件的描述信息
- 系谱数据
- 文件名称：Pedigree_MASPOT_parents.xlsx、F1_Parentage.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含18个亲本（栽培品种或育种材料）的系谱信息及F1群体的亲子关系数据
- 表型数据
- 文件名称：pt_full.txt、pt_with_G_no2013NDV.txt、pt_with_H_no2013NDV.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含5013个克隆的10个表型数据，包括干物质含量、产量、衰老等性状及试验设计信息（重复、区组等）
- 基因型数据
- 文件名称：gt0_nssynint_ordered_MASPOT.RData、snppos_combination.csv
- 文件格式：RData、CSV
- 字段映射介绍：93170个双等位基因SNP的基因型数据（过滤条件：MAF>1%、覆盖度5-60、缺失率<70%）及SNP的染色体位置信息
- 遗传矩阵数据
- 文件名称：Amatrix.RData、Gmatrix_inv_logdet.txt、Hmatrix.RData、Hmatrix_inv_logdet.txt、renum_H.txt、renum_ID_Ainv_pt_tetraploid_kerr_DR000.csv
- 文件格式：RData、TXT、CSV
- 字段映射介绍：系谱矩阵（A）、基因组矩阵（G）、单步合并矩阵（H）及其逆矩阵和对数行列式数据，包含矩阵元素及样本编号映射信息
数据来源
论文“Assessing the transmission potential of elite tetraploid potatoes”
适用场景
- 马铃薯遗传育种研究: 利用系谱、表型和基因型数据，分析四倍体马铃薯重要农艺性状的遗传规律
- 育种值估计: 通过系谱（A）、基因组（G）及单步合并（H）矩阵，开展马铃薯育种值的精确估计
- 标记辅助选择: 基于SNP基因型数据，开发马铃薯分子标记辅助选择技术
- 品种改良: 评估四倍体马铃薯亲本的传递潜力，为优良品种选育提供数据支持
- 数量遗传学分析: 研究马铃薯数量性状的遗传参数（遗传力、配合力等）及基因定位
