蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学数据集

数据集概述

该数据集包含研究中评估的所有病毒分支的比对文件和系统发育树,以及鉴定出的所有病毒序列的核苷酸序列数据,为分析蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学提供支持。

文件详解

该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 病毒序列文件: - final_viruses_contigs.fasta: FASTA格式文件,包含研究中鉴定出的所有病毒序列的核苷酸序列。 - 系统发育树文件 (.newick 格式): - 共20个文件,例如 Partiti_Picobirna_tree.newick、Anelloviridae_tree.newick、Cruciviridae_tree.newick 等,存储各病毒分支的系统发育树,含大于50的 bootstrap 值。 - 比对文件 (.phy 格式): - 共20个文件,例如 Partiti_Picobirna_alignment.phy、Luteo_Sobemo_alignment.phy 等,存储各病毒分支的序列比对数据。 - 系统发育树可视化文件 (.pdf 格式): - 共20个文件,例如 Luteo_Sobemo.pdf、Toti_Chryso.pdf 等,为各病毒分支系统发育树的PDF可视化文档。

适用场景

  • 病毒学研究: 分析蚂蚁相关病毒的多样性、分类及系统发育关系。
  • 进化生物学研究: 探究蚂蚁与病毒之间的协同进化动力学机制。
  • 比较基因组学分析: 基于病毒序列比对数据开展跨病毒分支的基因组特征比较。
  • 微生物生态学研究: 辅助研究蚂蚁宿主-病毒互作在生态系统中的作用。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 41.72 MiB
最后更新 2025年12月18日
创建于 2025年12月18日
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