数据集概述
该数据集包含研究中评估的所有病毒分支的比对文件和系统发育树，以及鉴定出的所有病毒序列的核苷酸序列数据，为分析蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学提供支持。
文件详解
该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下：
- 病毒序列文件:
- final_viruses_contigs.fasta: FASTA格式文件，包含研究中鉴定出的所有病毒序列的核苷酸序列。
- 系统发育树文件 (.newick 格式):
- 共20个文件，例如 Partiti_Picobirna_tree.newick、Anelloviridae_tree.newick、Cruciviridae_tree.newick 等，存储各病毒分支的系统发育树，含大于50的 bootstrap 值。
- 比对文件 (.phy 格式):
- 共20个文件，例如 Partiti_Picobirna_alignment.phy、Luteo_Sobemo_alignment.phy 等，存储各病毒分支的序列比对数据。
- 系统发育树可视化文件 (.pdf 格式):
- 共20个文件，例如 Luteo_Sobemo.pdf、Toti_Chryso.pdf 等，为各病毒分支系统发育树的PDF可视化文档。
适用场景
- 病毒学研究: 分析蚂蚁相关病毒的多样性、分类及系统发育关系。
- 进化生物学研究: 探究蚂蚁与病毒之间的协同进化动力学机制。
- 比较基因组学分析: 基于病毒序列比对数据开展跨病毒分支的基因组特征比较。
- 微生物生态学研究: 辅助研究蚂蚁宿主-病毒互作在生态系统中的作用。
