数据集概述
本数据集包含糖蛋白受体FSHR和LHCGR在SDPC脂质中轨迹的MD文件，涵盖PSF、PDB结构文件及charmm36m力场参数文件。PDB与trr文件仅保留主链原子，所有帧均已拟合至跨膜结构域。数据集共15个文件，支持生物分子动力学模拟相关研究。
文件详解
- 结构文件包
- 文件名称：LHCGR_PSF_PDB.zip、FSHR_PDB_PSF.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：压缩包包含LHCGR和FSHR受体的PSF（蛋白质结构文件）与PDB（蛋白质数据库文件）
- 分子动力学轨迹文件
- 文件名称：protein-lhcgr-R1-ps.trr、protein-lhcgr-R2-ps.trr、protein-lhcgr-R3-ps.trr
- 文件格式：TRR
- 内容说明：LHCGR受体不同构象（R1、R2、R3）的轨迹文件，仅含主链原子
- 蛋白质结构文件
- 文件名称：protein-lhcgr-R1.pdb、protein-lhcgr-R2.pdb、protein-lhcgr-R3.pdb
- 文件格式：PDB
- 内容说明：LHCGR受体不同构象的主链原子结构文件，已拟合至跨膜结构域
- 力场参数文件
- 拓扑文件（RTF）：top_all36_prot.rtf、top_all36_carb-ngly.rtf、top_all36_lipid.rtf
- 参数文件（PRM）：par_all36_lipid.prm、par_all36_prot.prm
- 结构参数文件（STR）：toppar_all36_lipid_prot.str、toppar_water_ions.str
- 内容说明：charmm36m力场的蛋白质、脂质、碳水化合物及水离子拓扑与参数文件
适用场景
- 糖蛋白受体结构分析：研究FSHR和LHCGR受体在SDPC脂质环境中的构象特征
- 分子动力学模拟：基于PSF/PDB文件及charmm36m参数开展受体动力学模拟研究
- 跨膜蛋白结构拟合验证：分析轨迹帧与跨膜结构域的拟合效果
- 生物分子力场应用：验证charmm36m力场在糖蛋白-脂质体系中的适用性
