MDVRY极化经典分子动力学软件包

数据集概述

本数据集包含MDVRY经典分子动力学软件包，用于研究气相和液相中的生物分子。该软件实现了基于Thole模型的点诱导偶极子静电极化，提供自洽方程求解和Car–Parrinello动力学两种诱导偶极子计算方案。

文件详解

• 文件名称: MDVRY a polarizable classical molecular dynamics package for biomolecules/aeby_v1_0.tar.gz
• 文件格式: GZ压缩包（.gz）
• 内容说明: 压缩包内包含MDVRY软件包的核心文件，未提供具体字段映射信息

数据来源

CPC Program Library（Queen's University Belfast）、Mendeley Data

适用场景

• 生物分子动力学模拟研究: 用于气相和液相环境下生物分子的结构与动态分析
• 极化力场计算: 研究静电极化效应对生物分子相互作用的影响
• 计算生物学方法验证: 比较不同诱导偶极子计算方案的模拟性能与精度
• 分子模拟软件应用: 为生物分子相关的计算研究提供工具支持