数据集概述
本数据集包含模式豆科植物蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)57个自然群体材料的53个基因片段核苷酸变异数据,涵盖开花通路相关基因11个、根瘤菌识别通路相关基因5个及对照基因37个,共检测到1757个多态位点,平均位点核苷酸多样性为0.003,用于分析开花与共生识别通路关键基因的自然选择信号。
文件详解
- 文件名称:alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含53个基因片段的序列比对数据,涉及11个开花相关基因、5个共生识别相关基因及37个对照基因的核苷酸多态性信息,具体字段需解压后查看序列比对文件内容。
数据来源
论文“Molecular adaptation in flowering and symbiotic recognition pathways: insights from patterns of polymorphism in the legume Medicago truncatula”
适用场景
- 豆科植物分子进化研究: 分析蒺藜苜蓿开花与共生识别通路基因的核苷酸多样性及选择压力。
- 适应性性状遗传机制分析: 探究自然选择对开花时间、根瘤菌识别等关键适应性性状相关基因的作用。
- 群体遗传学研究: 基于57个自然群体材料的基因多态性数据,解析群体结构与地理起源的关联。
- 进化生物学模型构建: 利用合并模拟方法验证选择中性模型的偏离,构建植物适应性进化的遗传模型。