数据集概述
本数据集包含通过Melange pipeline生成的Roseobacter sp. EG26菌株基因组的COG(直系同源蛋白簇)和Pfam(蛋白家族)注释结果。该菌株分离自葡萄牙东北大西洋海域的温带八放珊瑚Eunicella gazella,对应基因组组装的BioProject登录号为PRJNA1242562。数据集仅包含一个文件,用于支持其宿主相关生活方式的研究。
文件详解
- 文件名称:
Roseobacter_EG26_COG_Pfam_Annotation.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Roseobacter sp. EG26基因组序列的COG和Pfam功能注释信息,具体字段可能涵盖基因ID、COG注释分类、Pfam结构域信息、功能描述等(因无预览,基于注释类型推测)。
数据来源
研究“Genome sequence of the marine bacterium Roseobacter sp. EG26, isolated from the octocoral Eunicella gazella, suggests preference for a host-associated lifestyle”
适用场景
- 微生物基因组功能注释分析: 用于解析Roseobacter sp. EG26菌株的基因功能分类、蛋白家族组成及代谢潜能。
- 珊瑚共生微生物研究: 结合宿主来源背景,探究该菌株与八放珊瑚Eunicella gazella的共生关系及宿主相关生活方式的分子机制。
- 海洋微生物生态学研究: 分析温带大西洋海域珊瑚共生细菌的基因组特征与环境适应性。
- 生物信息学注释工具验证: 作为Melange pipeline注释结果的实例,用于评估该工具在微生物基因组功能注释中的应用效果。