meta3C_微生物染色体组织多样性研究数据_原始与说明文件

数据集概述

本数据集包含meta3C技术(宏基因组染色体构象捕获)相关的实验数据,用于研究微生物群落中染色体组织的多样性。通过细菌、酵母混合样本及环境样本的meta3C分析,验证了该技术在未知基因组组装、支架构建及三维结构表征中的应用潜力,共包含6个文件。

文件详解

  • 说明文件(.txt格式)
  • 文件名称:README_for_mix_11yeasts.zip.txt、README_for_mix_bacteria.zip.txt、README_for_mix_environmental_sample.zip.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:各混合样本的说明文档,以mix_11yeasts样本为例,包含组装序列(contigs_mix11yeasts.fa)、contig-群落对应关系(graph_node2community_11yeasts)、接触图谱(matrice_11yeasts_3C_bin_200frags.txt)等文件的描述
  • 压缩文件(.zip格式)
  • 文件名称:mix_11yeasts.zip、mix_bacteria.zip、mix_environmental_sample.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:分别对应11种酵母混合样本、细菌混合样本、环境样本的meta3C实验数据压缩包,内含组装序列、群落关联数据、接触图谱等核心分析文件

数据来源

eLife科学期刊文章“Metagenomic chromosome conformation capture (meta3C) unveils the diversity of chromosome organization in microorganisms”

适用场景

  • 微生物染色体结构研究: 分析不同微生物类群(细菌、酵母)的染色体三维组织多样性
  • 宏基因组组装技术验证: 评估meta3C技术在未知微生物基因组组装与支架构建中的应用效果
  • 环境微生物群落分析: 通过半复杂环境样本数据,探究自然环境中微生物染色体组织特征
  • 基因组学方法学研究: 探索宏基因组学中染色体构象捕获技术的实验设计与数据分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 78.67 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。