数据集概述
本数据集为墨西哥湾北部(莫比尔湾及阿拉巴马大陆架)中上层微真核生物群落的 metabarcoding 研究数据,涵盖2009年7月至2011年12月双月采样的群落组成与环境因子关联信息,包含OTU表、分类注释及说明文档等7个文件,用于揭示微真核生物时空变化规律及驱动因素。
文件详解
- 说明文档(README文件)
- 文件名称:
README_for_otu_table_mc2_w_tax_from_biom.xlsx、README_for_otu_table_mc2_w_tax_no_pynast_failures_bac_arc_removed_from_biom.xlsx、README_for_otu_table_mc2_w_tax_no_pynast_failures_bac_arc_removed_reps_combined_from_biom.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:分别对应不同OTU表的说明文档,可能包含数据生成方法、处理步骤、字段定义及注释规则等内容。
- OTU表数据文件(TXT文件)
- 文件名称:
otu_table_mc2_w_tax_no_pynast_failures_bac_arc_removed_from_biom.txt、otu_table_mc2_w_tax_no_pynast_failures_bac_arc_removed_reps_combined_from_biom.txt、otu_table_mc2_w_tax_from_biom.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:OTU(操作分类单元)表,包含OTU ID及各采样点(如MB.Jul.2009.A、DI.May.2010.B等)的丰度数据,部分文件已去除细菌/古菌序列、合并重复样本或保留原始分类注释。
- 代表性序列文件
- 文件名称:
rep_set.fna
- 文件格式:FNA
- 字段映射介绍:OTU的代表性序列文件,用于物种分类比对与系统发育分析。
数据来源
论文“Metabarcoding reveals environmental factors influencing spatio-temporal variation in pelagic micro-eukaryotes”
适用场景
- 海洋微生态时空动态研究: 分析墨西哥湾北部中上层微真核生物群落组成的季节变化与空间分布规律。
- 环境因子关联分析: 探究盐度、温度、溶解硅酸盐等环境参数对微真核生物群落结构的影响。
- 生态监测技术应用: 验证 metabarcoding 技术在长期海洋生态监测中的有效性与稳定性。
- 物种相互作用推测: 基于群落组成差异推测捕食、寄生等物种间相互作用对群落结构的潜在影响。
- 海洋生态健康评估: 通过微真核生物群落稳定性与多样性特征,反映海洋生态系统健康状态。