数据集概述
本数据集为太平洋表、中层浮游桡足类大规模宏条形码分析结果，覆盖太平洋70个站位及北冰洋3个站位。数据揭示群落结构、多样性分布规律，验证"热带起源"理论，探讨进化过程与环境因子（如海水温度）对桡足类多样性的影响，含8个相关文件。
文件详解
- 生物信息学协议文件
- 文件名称：Bioinformatic_protocol.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：宏条形码分析的生物信息学流程操作说明文档
- 引物序列文件
- 文件名称：JH_primer_forward.txt、JH_primer_reverse_forRF.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：含正向引物（如AGACCGATAGCAAACAAGTAC）和反向引物序列信息
- 参考序列文件
- 文件名称：JH_MAFFT_reference.fasta、JH_MAFFT_reference_name.accnos
- 文件格式：FASTA、ACCNOS
- 字段映射介绍：MAFFT比对用参考序列库及对应序列编号
- OTU数据文件
- 文件名称：final_copepod_OTUs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：最终桡足类操作分类单元（OTU）数据表格
- 分类学文件
- 文件名称：JH_taxonomy_file.taxonomy
- 文件格式：TAXONOMY
- 字段映射介绍：OTU对应的分类学注释信息
- 模板序列文件
- 文件名称：JH_template_file.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：宏条形码分析用模板序列文件
适用场景
- 海洋浮游生物群落结构研究: 分析太平洋表、中层桡足类群落组成与分布规律
- 生物多样性进化分析: 验证"热带起源"理论，探讨桡足类纬度多样性梯度形成机制
- 环境因子关联研究: 探究海水温度等环境因子对桡足类多样性的影响
- 全球气候变化响应预测: 基于多样性与海表温度的相关性，预测全球变暖对桡足类多样性的影响
- 宏条形码技术应用: 参考生物信息学流程与引物设计，开展类似浮游生物宏条形码研究
