数据集概述
本数据集基于加利福尼亚海藻林的DNA元条形码COI单倍型数据，分析527种动植物的种群丰度、扩散模式与种群历史，覆盖蒙特利湾106个底栖生境样本。数据通过单倍型单元揭示物种空间分布差异、种群遗传分化及种群动态历史，提升元条形码研究的生态与遗传分析价值。
文件详解
- 数据文件1
- 文件名称：haploCOBB_pipeline.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含HaploCOBB分析流程相关文件，用于单倍型数据的处理与分析
- 数据文件2
- 文件名称：PopGen.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含种群遗传学分析相关文件，用于物种空间遗传分化研究
- 数据文件3
- 文件名称：HaploCOBB_table.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：单倍型分析结果表格，记录物种单倍型多样性、种群丰度等核心数据
- 数据文件4
- 文件名称：Rscript.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含R语言分析脚本，用于数据处理、统计分析与可视化
数据来源
论文“Testing small scale ecological gradients and intraspecific differentiation for hundreds of kelp forest species using haplotypes from metabarcoding”
适用场景
- 海洋物种生态梯度研究：分析海藻林物种在小尺度空间内的丰度分布差异与生境适应性
- 种群遗传分化分析：探究红藻、海绵等物种的种内遗传结构与空间分化模式
- 种群动态历史重建：通过单倍型错配频率系统发育分析，推断物种种群扩张或稳定历史
- 元条形码数据拓展应用：利用物种水平分析同步产生的单倍型数据，提升海洋生态研究的深度与广度
