数据集概述
本数据集来自22天水体中尺度实验,通过宏条形码和代谢组分析,探究桡足类(Calanus sp.)摄食偏好与浮游生物群落代谢物类别的关联。实验设置营养添加组,观察定鞭藻和硅藻主导群落中桡足类的摄食选择,分析其与碳水化合物、脂质等代谢物的关系,共包含4个数据文件。
文件详解
- Taxonomic_assignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包,推测包含分类学注释相关的原始或中间数据文件
- CREST_taxonomy_table.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含多个样本列(如Copepod_Mesocosm_Control_11等),记录不同处理组样本的分类学组成数据
- Ray_et_al-AmpliconNoise_OTUs_taxonomic_assignments.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录OTU(如C46、C51等)的分类学注释结果,部分OTU显示“No hits”(无匹配结果)
- Ray_et_al-AmpliconNoise_OTUs_cutoff98.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含OTUs列及多个样本列(如COP_NP11、COP_NPSi11等),记录98%相似度 cutoff 下的OTU丰度数据
数据来源
论文“Metabarcoding and metabolome analyses of copepod grazing reveal feeding preference and linkage to metabolite classes in dynamic microbial plankton communities”
适用场景
- 海洋浮游生物群落动态研究: 分析营养添加对定鞭藻、硅藻主导群落演替的影响
- 桡足类摄食生态学研究: 利用分类学数据探究桡足类对不同浮游生物类群的摄食偏好
- 浮游生物代谢组关联分析: 研究桡足类摄食与浮游生物碳水化合物、脂质等代谢物类别的关系
- 宏条形码技术应用验证: 评估AmpliconNoise流程在浮游生物群落分类学注释中的效果