数据集概述
本数据集是基于新宏条形码策略研究土壤线虫群落的实验数据,包含四种引物组(JB3/JB5、SSU_04F/SSU_22R、Nemf/18Sr2b、MMSF/MMSR)对86份DNA样本(线虫个体、模拟群落、土壤样本等)的测序结果,用于评估不同引物组检测土壤线虫群落的效率。
文件详解
- JB_otutable_added taxa.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:JB3/JB5引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
- MMS_otutable_added taxa.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:MMSF/MMSR引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
- NEM_otutable_added taxa.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:Nemf/18Sr2b引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
- SSU_otutable_added taxa.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:SSU_04F/SSU_22R引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
数据来源
论文“A novel metabarcoding strategy for studying nematode communities”
适用场景
- 土壤线虫群落多样性分析: 比较不同引物组对土壤线虫群落物种检测的覆盖度和准确性
- 宏条形码引物效率评估: 评估JB、MMS、NEM、SSU四组引物在土壤线虫群落研究中的适用性
- 农业土壤生态监测: 利用高效引物组数据研究农业环境中线虫群落的结构与动态
- 土壤生物多样性研究: 分析土壤中线虫群落的物种组成及相对丰度,揭示土壤生态系统健康状况