metabarcoding_Nematode_Based土壤线虫群落新宏条形码策略实验数据

数据集概述

本数据集是基于新宏条形码策略研究土壤线虫群落的实验数据,包含四种引物组(JB3/JB5、SSU_04F/SSU_22R、Nemf/18Sr2b、MMSF/MMSR)对86份DNA样本(线虫个体、模拟群落、土壤样本等)的测序结果,用于评估不同引物组检测土壤线虫群落的效率。

文件详解

  • JB_otutable_added taxa.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:JB3/JB5引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
  • MMS_otutable_added taxa.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:MMSF/MMSR引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
  • NEM_otutable_added taxa.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:Nemf/18Sr2b引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息
  • SSU_otutable_added taxa.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:SSU_04F/SSU_22R引物组的OTU表及分类单元注释数据,包含线虫群落的物种组成及相对丰度信息

数据来源

论文“A novel metabarcoding strategy for studying nematode communities”

适用场景

  • 土壤线虫群落多样性分析: 比较不同引物组对土壤线虫群落物种检测的覆盖度和准确性
  • 宏条形码引物效率评估: 评估JB、MMS、NEM、SSU四组引物在土壤线虫群落研究中的适用性
  • 农业土壤生态监测: 利用高效引物组数据研究农业环境中线虫群落的结构与动态
  • 土壤生物多样性研究: 分析土壤中线虫群落的物种组成及相对丰度,揭示土壤生态系统健康状况
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.91 MiB
最后更新 2026年1月13日
创建于 2026年1月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。