数据集概述
本数据集为Elkhorn Slough微生物垫宏基因组分箱与注释的补充测序及注释数据，包含3个共组装数据集的MG-RAST注释、不同k-mer值（k29、k45、k63）共组装的 scaffolds 及Prodigal预测ORFs，以及用于分箱的scaffold覆盖度和注释信息，共5个压缩文件。
文件详解
- Mats.Combined.Annotations.IP.GN.RS.IMG.PA.SE.KO.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含3个宏基因组分箱数据集的MG-RAST注释数据，注释来源包括Interpro、GenBank、RefSeq、IMG、PATRIC、SEED和KEGG数据库
- k63.seq.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：k63共组装的scaffolds序列及Prodigal预测的开放阅读框（ORFs）数据
- k45.seq.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：k45共组装的scaffolds序列及Prodigal预测的开放阅读框（ORFs）数据
- k29.seq.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：k29共组装的scaffolds序列及Prodigal预测的开放阅读框（ORFs）数据
- binning.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：用于宏基因组分箱的scaffold覆盖度数据及相关注释信息
适用场景
- 微生物群落结构分析：通过不同k-mer共组装数据研究Elkhorn Slough微生物垫的物种组成与丰度
- 功能基因注释研究：利用多数据库注释信息分析微生物垫中功能基因的分布与代谢潜力
- 宏基因组分箱优化：基于scaffold覆盖度和注释数据探索分箱算法的性能与参数优化
- 环境微生物生态研究：结合注释数据解析Elkhorn Slough生态系统中微生物的代谢功能与环境适应性
