数据集概述
本数据集为分层湖盆中Candidatus 'Methylomirabilis'介导的亚硝酸盐依赖型厌氧甲烷氧化相关研究数据，包含处理后的16S rRNA扩增子序列数据、微生物相对丰度数据及卢加诺湖北部盆地多年水体化学数据，可支持湖泊水体动力学对微生物甲烷氧化过程的调控机制研究。
文件详解
- 测序分析相关文件
- 映射文件：
Lugano2016_map file.txt，格式TXT，包含样本元数据（如温度、深度、DNA浓度等）
- 序列变体表：
Lugano2016_ZOTU table.txt，格式TXT，记录每个样本的扩增子序列变体（ZOTU）读数丰度及分类学信息
- 序列文件：
Lugano2016_sequence file.fasta，格式FASTA，包含鉴定出的ASV序列
- 树文件：
Lugano2016_tree file.tre，格式TRE，用于系统发育分析的树结构文件
- 微生物丰度数据
- 原始数据：
Raw data - Relative abundance of three dominant methanotrohps in North Basin 2009-2018.xlsx，格式XLSX，2009-2018年卢加诺湖北部盆地三种优势甲烷氧化菌相对丰度原始数据
- 处理后数据：
Relative abundance of three dominant methanotrohps in North Basin 2009-2018.csv，格式CSV，上述数据的CSV格式版本
- 水体化学数据
- 多年数据集：
Raw data - ZOTU table Gandria 2015-2018.xlsx，格式XLSX，2015-2018年甘德里亚区域ZOTU表及相关数据
- 箱线图数据：
Lake_Lugano_Boxplot.csv，格式CSV，包含年份、日期、深度、温度、溶解氧、氮化合物（NO3、NO2、NH4）、甲烷（CH4）等水体化学参数
- 网络分析数据
100 ZOTUs Gandria 2015-2018 for network analysis.csv，格式CSV，2015-2018年甘德里亚区域100个ZOTU的网络分析数据- 代码文件
Scripts for figures.R，格式R，用于生成论文图表的R脚本- 说明文件
Readme.txt，格式TXT，数据集说明文档
数据来源
论文"Water column dynamics control nitrite-dependent anaerobic methane oxidation by Candidatus 'Methylomirabilis' in stratified lake basins"（ISME Journal, 2023）
适用场景
- 湖泊微生物生态学研究：分析分层湖盆中Candidatus 'Methylomirabilis'的分布特征及生态功能
- 水体动力学调控机制研究：探究湖泊水体分层、温度、溶解氧等动力学因素对微生物甲烷氧化过程的影响
- 甲烷生物地球化学循环分析：利用甲烷及氮化合物数据，研究湖泊生态系统中甲烷的厌氧氧化途径
- 微生物群落网络分析：基于ZOTU数据开展湖泊微生物群落的共发生网络研究
- 环境因子关联分析：分析水体化学参数（如NO2、CH4浓度）与甲烷氧化菌丰度的相关性
