数据集概述
本数据集为北大西洋露脊鲸主要组织相容性复合体(MHC)基因座特征研究的补充材料,包含4份文件。研究通过222个个体的基因扩增和81个亲子系谱分析,揭示了至少11个II类DRB样等位基因、12种单倍型,以及I类基因座和假基因的变异情况,为分析该物种MHC变异性与健康繁殖的关系提供基础数据。
文件详解
- 文件名称:Supplementary Material - Right Whale Family Groups.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含北大西洋露脊鲸的家族群体信息,支持系谱分析中亲子关系及等位基因分离模式的验证。
- 文件名称:Supplementary Material - SSCP Image.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含单链构象多态性(SSCP)图像数据,用于基因分型和等位基因变异的可视化分析。
- 文件名称:Supplementary Material - MHC Class II Nucleotide Alignment.rtf
- 文件格式:RTF
- 字段映射介绍:包含II类MHC基因的核苷酸序列比对结果,支持等位基因序列差异和选择压力的分析。
- 文件名称:Supplementary Material - MHC Haplotypes.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录了通过系谱分析确定的12种MHC单倍型信息,反映等位基因的组合模式。
数据来源
论文“Characterization of class I- and II-like major histocompatibility complex loci in pedigrees of North Atlantic right whales”
适用场景
- 鲸类分子遗传学研究:分析北大西洋露脊鲸MHC基因的变异水平、等位基因分布及单倍型特征。
- 进化选择压力分析:通过II类基因肽结合区序列,研究平衡选择对MHC基因的影响机制。
- 物种健康评估:探索MHC变异性与露脊鲸健康状况、繁殖成功率之间的关联。
- 保护遗传学应用:为濒危鲸类的遗传多样性保护策略制定提供分子遗传学数据支持。