数据集概述
本数据集围绕大山雀野生种群的主要组织相容性复合体(Mhc)基因展开,包含从标记重捕及长期繁殖数据中提取的Mhc基因功能多样性与个体适合度(生存、年度繁殖成功率、终生繁殖成功率)关联分析相关数据,共6个文件,用于验证Mhc多样性与适合度的三类假设。
文件详解
- 文件名称:Allele vs. supertype information.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:Mhc等位基因与功能超型(supertype)的对应关系信息
- 文件名称:MARK input dataset.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:用于标记重捕分析(MARK方法)的输入数据集,包含个体生存相关的标记与捕获数据
- 文件名称:reproductive performance dataset.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:年度繁殖表现数据集,记录个体年度繁殖成功率相关指标
- 文件名称:raw 454 sequence data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:原始454测序数据压缩包,包含Mhc基因的原始序列信息
- 文件名称:LRS dataset.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:终生繁殖成功率(LRS)数据集,记录个体终生繁殖相关指标
- 文件名称:individual sequence dataset.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:个体Mhc基因序列数据集,包含每个个体的Mhc基因序列信息
数据来源
论文“Mhc-linked survival and lifetime reproductive success in a wild population of great tits”
适用场景
- 生态遗传学研究:分析Mhc基因功能多样性与野生种群个体适合度的关联机制
- 适应性进化研究:验证Mhc基因多样性对野生种群生存、繁殖等适合度组分的选择作用
- 种群动态分析:利用标记重捕数据与繁殖数据,探究Mhc基因对种群长期动态的影响
- 分子生态学研究:通过Mhc基因序列数据,研究野生种群的遗传多样性与适应性进化策略