数据集概述
本数据集围绕养殖溪红点鲑（Salvelinus fontinalis）种群的MHC基因多样性与表达展开，研究中性与选择过程对其的影响，以及人工养殖个体补充对宿主-寄生虫互作动态的干扰。包含基因序列、寄生虫感染数据、基因型数据及实验室实验数据，共6个文件，覆盖2008至2012年研究周期。
文件详解
- MHC基因序列文件
- 文件名称：MHC_alleles_aligned_10-04-2012.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含2012年4月10日对齐的MHC等位基因序列数据，记录溪红点鲑MHC基因的核苷酸序列信息。
- 测序数据压缩包
- 文件名称：454_seq_2011090210000039.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：2011年9月2日生成的454测序数据压缩包，内含原始测序相关文件。
- 寄生虫感染数据文件
- 文件名称：data_2008-2009_parasites_MEC-13-1125.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录2008-2009年溪红点鲑寄生虫感染相关数据，包含感染个体信息、寄生虫种类及感染程度等指标。
- 2009年研究数据文件
- 文件名称：data_2009_MEC-13-1125.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：2009年溪红点鲑研究相关数据，具体内容涵盖种群补充、基因表达或宿主-寄生虫互作等实验数据。
- MHCII基因型数据文件
- 文件名称：data_genotype_2008_MHCII.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：2008年溪红点鲑MHCII基因型数据，记录个体MHCII基因的基因型信息。
- 实验室实验数据文件
- 文件名称：data_laboratory-experiment.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：实验室实验相关数据，包含实验设计、操作过程及结果记录等信息。
数据来源
论文“Neutral and selective processes shape MHC gene diversity and expression in stocked brook charr populations (Salvelinus fontinalis)”
适用场景
- 鱼类免疫基因进化研究：分析MHC基因多样性在养殖溪红点鲑种群中的分布及进化规律，探究中性与选择过程的作用机制。
- 水产养殖种群健康评估：通过寄生虫感染数据与MHC基因表达的关联分析，评估人工养殖补充对溪红点鲑免疫能力的影响。
- 宿主-寄生虫互作机制研究：结合基因型数据与感染数据，解析MHC等位基因与特定寄生虫类群的关联模式。
- 水产养殖遗传管理：为养殖溪红点鲑种群的遗传多样性保护及免疫性状选育提供数据支持。
- 实验室实验验证：利用实验室实验数据，验证野外观察到的MHC基因表达与免疫表型的关系。
