数据集概述
本数据集为地中海褐鳟MHC基因多样性进化研究的存档数据，包含156尾意大利中部野生褐鳟的MHC-DAB基因（适应性）、11个微卫星位点（中性）及LDH基因（渐渗评估）数据，分析平衡选择、遗传漂变与人类介导渐渗对MHC多样性的影响，涉及6个文件，涵盖基因型、表型、测序数据等。
文件详解
- README.docx：DOCX格式，数据集说明文档，介绍研究背景、数据内容及使用方法
- MHC-DAB_genotypes_AmpliSAS.xlsx：XLSX格式，MHC-DAB基因分型数据，包含AmpliSAS分析结果
- phenotypic_genetic_data.csv：CSV格式，表型与遗传数据，字段包括样本编号、种群、体况（BC）、LDH基因型、MHC等位基因/超型及频率等
- Brown_trout_MHC_fastq_paired.zip：ZIP格式，MHC基因双端测序原始数据压缩包
- MHC_STR_genotypes.xlsx：XLSX格式，微卫星位点（STR）分型数据
- Brown_trout_amplicon_data-batches.txt：TXT格式，扩增子批次数据，包含种群、样本、批次及标签序列信息
适用场景
- 进化生物学研究：分析平衡选择、遗传漂变与渐渗对MHC基因多样性的协同作用
- 分子生态学研究：探究地中海褐鳟野生种群MHC基因与中性位点的群体结构差异
- 鱼类保护遗传学：评估人类介导的养殖品种渐渗对野生褐鳟适应性基因多样性的影响
- 病原体介导选择验证：验证MHC稀有等位基因优势假说在自然种群中的适用性
- 表型-基因型关联分析：研究MHC等位基因/超型与个体体况（ fitness proxy）的相关性
