数据集概述
本数据集包含使用Micro-Meta App生成的显微镜元数据JSON文件及对应的示例图像文件,记录了自定义构建的TIRF epi荧光结构照明显微镜(TESM)的硬件规格和图像采集设置,支持生物医学成像实验的元数据标准化管理与复现。
文件详解
- 硬件规格文件
- 文件名称:rigano_et_al_2021_umms_big_olympus_ix71_tesm.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:记录基于Olympus IX71显微镜搭建的TESM硬件规格,符合4DN-BINA-OME显微镜元数据模型Tier 3标准
- 成像设置文件
- 文件名称:rigano_et_al_2021_fswt-6hvirus-10minfix-stk_4-epi.tif_as.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:记录示例图像FSWT-6hVirus-10minFIX-stk_4-EPI.tif.ome.tif的采集参数设置
- 示例图像文件
- 文件名称:FSWT-6hVirus-10minFIX-stk_4-EPI.tif.ome.tif
- 文件格式:TIFF
- 字段映射介绍:HIV-1感染TZM-bl细胞的荧光成像结果,包含p24病毒衣壳、Lamin B1核膜及DAPI染色的多通道图像数据
数据来源
论文相关案例(Rigano et al., 2021 Figure 5)
适用场景
- 生物医学成像实验复现:基于硬件规格和成像设置元数据,复现HIV-1病毒感染细胞的荧光成像实验
- 显微镜元数据标准化研究:验证4DN-BINA-OME元数据模型在自定义显微镜系统中的应用效果
- 成像参数优化分析:通过对比不同成像设置对应的图像数据,优化TIRF结构照明显微镜的采集参数
- 生物图像数据管理:为生物医学图像数据集提供标准化的元数据管理模板与示例
- 显微镜硬件文档管理:为自定义搭建的TESM显微镜提供结构化的硬件规格文档,支持设备维护与升级