数据集概述
本数据集提供了感染两种新西兰螺类（Potamopyrgus antipodarum和P. estuarinus）的绝育吸虫Microphallus sp.的转录组资源，包括首次注释的转录组组装结果及相关遗传分析数据，填补了螺类吸虫基因组和转录组资源的空白，助力宿主-寄生虫协同进化、局部适应等研究。
文件详解
- 转录组组装文件
- 文件名称：PE-Microphallus_annotated_transcriptome.fasta、PA-Microphallus_annotated_transcriptome.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：分别为感染P. estuarinus和P. antipodarum的Microphallus吸虫的注释转录组序列
- 遗传分析数据文件
- 文件名称：Theta_per_transcript_data.xlsx、Pairwise_distance_data.xlsx、Microsatellites_and_primer_data.xlsx、Fst_per_SNP_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含转录组水平的Theta值、两两距离、微卫星及引物信息、SNP水平的Fst值等遗传分析数据
数据来源
De novo transcriptome characterization of a sterilizing trematode parasite (Microphallus sp.) from two species of New Zealand snails
适用场景
- 宿主-寄生虫协同进化研究：分析两种螺类寄生吸虫的遗传分化，探究协同进化机制
- 寄生虫局部适应研究：利用转录组数据识别与盐度胁迫等环境适应相关的候选基因
- 分子进化与系统发育分析：基于转录组序列开展吸虫类群的分子进化和系统发育研究
- 寄生感染机制研究：挖掘参与寄生感染过程的关键基因，解析寄生虫致病机制
