数据集概述
本数据集为Dysaphis plantaginea(车前蚜)的微卫星数据集,包含三十组微卫星数据、ABCRF脚本及输入文件、PCA脚本及输入文件、splitstree脚本及输入文件,以及用于绘制STRUCTURE推断的成员系数分布的脚本。数据集共包含5个文件,支持昆虫种群遗传学相关分析。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:Pucerons_all_GenAlex_with_clones.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Dysaphis plantaginea的微卫星数据,可能涉及基因分型信息及克隆相关数据,适用于GenAlex分析
- 归档文件
- 文件名称:ABC.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含ABCRF脚本及输入文件,用于相关基因数据分析
- 文件名称:Splitstree.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含splitstree脚本及输入文件,用于构建系统发育树
- 文件名称:plot_membership_coefficient_STRUCTURE.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含绘制STRUCTURE推断的成员系数分布的脚本
- 文件名称:PCA.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含PCA脚本及输入文件,用于主成分分析
适用场景
- 昆虫种群遗传学研究: 利用微卫星数据进行Dysaphis plantaginea种群结构分析
- 基因数据分析: 通过ABCRF、PCA等脚本进行基因数据的统计分析与可视化
- 系统发育关系构建: 使用splitstree脚本构建Dysaphis plantaginea的系统发育树
- 种群成员系数分析: 绘制STRUCTURE推断的成员系数分布,研究种群遗传结构